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办理连山县医疗器械经营许可证需要遵循以下流程：

1、申请企业需先登录广东省药品监督管理局智慧食药监平台，进行网上申报。

2、准备相关材料，包括：
营业执照和组织机构代码证复印件（新办企业提供工商行政管理部门出具的名称预先核准通知书）。
法定代表人、企业负责人、质量负责人的身份证明、学历或者职称证明复印件。
组织机构与部门设置说明。
经营范围、经营方式说明。
经营场所、库房地址的地理位置图、平面图、房屋产权证明文件或者租赁协议（附房屋产权证明文件）复印件。
经营设施、设备目录。
经营质量管理制度、工作程序等文件目录。
计算机信息管理系统基本情况介绍和功能说明（第二类医疗器械经营企业适用）。

3、将纸质材料提交至连山县市场监督管理局医疗器械监管科。

4、监管部门受理后会安排现场核查。

5、核查通过后，监管部门会在规定时间内做出是否准予许可的决定。

6、准予许可的，发放《医疗器械经营许可证》。

建议在准备过程中仔细阅读当地市场监管部门发布的具体要求和指南，确保所有材料准确无误。如果对某些条款或流程存在疑问，可以向当地市场监管部门咨询。